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 上海分院是中國科學院的派出機構，負責聯(lián)系和管理中國科學院在上海、浙江、福建地區(qū)的研究院所工作。上海分院始于1950年3月經(jīng)政務院批準成立的中科院華東辦事處，接管并改造了原中央研究院和北平研究院在上海、南京的研究機構，1958年11月成立上海分院，1961年改為華東分院，1970年中科院撤消分院體制，1977年11月恢復成立中科院上海分院。

　 上海分院系統(tǒng)現(xiàn)有14個法人研究機構：上海微系統(tǒng)與信息技術研究所、上海硅酸鹽研究所、上海光學精密機械研究所、上海應用物理研究所、上海技術物理研究所、上海有機化學研究所、上海生命科學研究院、上海天文臺、上海藥物研究所、上海巴斯德研究所、福建物質結構研究所、寧波材料技術與工程研究所、城市環(huán)境研究所和上海高等研究院。上海分院系統(tǒng)有13個國家重點實驗室、31個中科院重點實驗室，以及中科院上海教育基地、中科院上海國家技術轉移中心、中科院上海交叉學科研究中心。

　 上海分院各研究所學科領域廣泛，在優(yōu)勢研究領域有著長期的積累：在物質科學與技術領域，包括同步輻射、核科學與核技術、高能量密度物理、有機化學與有機材料、無機非金屬材料和金屬材料、天體物理、天文地球動力學和技術方法等；在信息科學與技術領域，包括通信技術、微電子技術、光電子技術、激光技術、紅外技術等；在生命科學與技術領域，包括生物化學與分子生物學、細胞生物學、神經(jīng)生物學、植物生理學、分子遺傳學、創(chuàng)新藥物和生物技術、病毒學與免疫學、健康營養(yǎng)研究等。同時加強學科交叉和融合，加強系統(tǒng)集成和提供解決方案的能力，在信息、新能源、新材料、空間、海洋、人口健康以及大科學工程等領域著力部署，不斷提高創(chuàng)新能力和科研水平。

　 上海分院凝聚和培養(yǎng)了一大批優(yōu)秀的科技創(chuàng)新人才，現(xiàn)有一支10992人的科研、管理和支撐隊伍，其中專業(yè)技術人員9213人，所占比例83.8%，其中高級研究人員3242人。目前擁有的高端人才隊伍中，有中國科學院院士48人，中國工程院院士11人，“千人計劃”64人，國家杰出青年基金獲得者135人，國家自然科學基金委創(chuàng)新群體20個，60人擔任國家“973”項目首席科學家，103人擔任國家863項目負責人。

　 上海分院始終堅持服務國家、造福人民的創(chuàng)新價值理念，努力發(fā)揮科學技術是第一生產(chǎn)力的重要作用，不斷提升自主創(chuàng)新能力，取得了一個又一個標志著我國科技發(fā)展水平的重大成果。

　 通過在體制機制、人才隊伍、平臺建設等方面的一系列創(chuàng)新舉措，上海分院發(fā)揮綜合優(yōu)勢，切實落實科學技術是第一生產(chǎn)力的重要作用，積極推進傳統(tǒng)產(chǎn)業(yè)轉型升級，培育引領戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)，在物聯(lián)網(wǎng)、智能電網(wǎng)、新藥創(chuàng)制、新能源汽車等領域做出了開拓性貢獻。

　 隨著知識創(chuàng)新工程的不斷深入開展，中科院上海分院黨組、中科院滬區(qū)黨委結合科技創(chuàng)新實際提出了“圍繞創(chuàng)新抓黨建、抓好黨建促創(chuàng)新”的工作理念。

　 上海分院積極發(fā)揮資源優(yōu)勢，不斷探索科教結合的新模式，培養(yǎng)造就了一大批素質高、重實踐、綜合能力強的創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)人才。上海分院目前在學碩、博士生5850余人，其中博士生2891人；目前有16個一級學科，52個二級學科，11個一級學科博士點。

　 上海分院高度重視國際合作，積極開展全方位、多層次、高水平的國際科技交流，多途徑拓展國際合作局面，與全球20多個國家的430余個機構建立了友好合作關系，每年出訪和接待來訪人數(shù)都超過千余人次，有效的提升了自身創(chuàng)新能力，擴大了國際影響力。

　 上海分院以科學知識的重要傳播者、科學方法的典型示范者、科學思想和科學精神的積極倡導者為己任，發(fā)揮院士專家作用，借助“走進科學院”、“科技活動周”、“公眾科學日”、“科普大講壇”等科普平臺，加強科學傳播，弘揚科學精神，為提高社會公眾的科學素養(yǎng)做貢獻。